SELECT data_key, data_value
FROM xf_data_registry
WHERE data_key IN ('options', 'languages', 'contentTypes', 'codeEventListeners', 'deferredRun', 'simpleCache', 'addOns', 'defaultStyleProperties', 'routeFiltersIn', 'routeFiltersOut', 'routesPublic', 'nodeTypes', 'bannedIps', 'discouragedIps', 'styles', 'displayStyles', 'userBanners', 'smilies', 'bbCode', 'threadPrefixes', 'userTitleLadder', 'reportCounts', 'moderationCounts', 'userModerationCounts', 'notices', 'userFieldsInfo')Run Time: 0.000615
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|---|
| SIMPLE | xf_data_registry | range | PRIMARY | PRIMARY | 27 | | 26 | Using where |
SELECT data_key, data_value
FROM xf_data_registry
WHERE data_key IN ('brListenerClasses', 'brBriviumAddOns')Run Time: 0.000166
| Select Type | Table | Type | Possible Keys | Key | Key Len | Ref | Rows | Extra |
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| SIMPLE | xf_data_registry | range | PRIMARY | PRIMARY | 27 | | 2 | Using where |
SELECT *
FROM xf_brivium_addon
ORDER BY addon_id
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|---|
| SIMPLE | xf_brivium_addon | index | | PRIMARY | 77 | | 1 | |
INSERT INTO xf_data_registry
(data_key, data_value)
VALUES
(?, ?)
ON DUPLICATE KEY UPDATE
data_value = VALUES(data_value)
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Run Time: 0.000127
SELECT session_data
FROM xf_session
WHERE session_id = ?
AND expiry_date >= ?
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|---|
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FROM xf_permission_combination
WHERE permission_combination_id = ?
Params: 1
Run Time: 0.000160
| Select Type | Table | Type | Possible Keys | Key | Key Len | Ref | Rows | Extra |
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| SIMPLE | xf_permission_combination | const | PRIMARY | PRIMARY | 4 | const | 1 | |
SELECT thread.*
,
user.gender, user.avatar_date, user.gravatar,
NULL AS thread_read_date,
0 AS thread_reply_banned,
0 AS thread_is_watched,
'' AS draft_message, NULL AS draft_extra
FROM xf_thread AS thread
LEFT JOIN xf_user AS user ON
(user.user_id = thread.user_id)
WHERE thread.thread_id = ?
Params: 313335
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| Select Type | Table | Type | Possible Keys | Key | Key Len | Ref | Rows | Extra |
|---|
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| SIMPLE | user | const | PRIMARY | PRIMARY | 4 | const | 1 | |
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,
permission.cache_value AS node_permission_cache,
NULL AS forum_read_date
FROM xf_forum AS forum
INNER JOIN xf_node AS node ON (node.node_id = forum.node_id)
LEFT JOIN xf_permission_cache_content AS permission
ON (permission.permission_combination_id = 1
AND permission.content_type = 'node'
AND permission.content_id = forum.node_id)
WHERE node.node_id = ?
Params: 25
Run Time: 0.000388
| Select Type | Table | Type | Possible Keys | Key | Key Len | Ref | Rows | Extra |
|---|
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| SIMPLE | node | const | PRIMARY | PRIMARY | 4 | const | 1 | |
| SIMPLE | permission | const | PRIMARY | PRIMARY | 35 | const,const,const | 1 | |
SELECT post.*
,
thread.*, thread.user_id AS thread_user_id, thread.username AS thread_username,
thread.post_date AS thread_post_date,
post.user_id, post.username, post.post_date,
bb_code_parse_cache.parse_tree AS message_parsed, bb_code_parse_cache.cache_version AS message_cache_version,
user.*, IF(user.username IS NULL, post.username, user.username) AS username,
user_profile.*,
user_privacy.*,
signature_parse_cache.parse_tree AS signature_parsed, bb_code_parse_cache.cache_version AS signature_cache_version,
session_activity.view_date AS last_view_date,
0 AS like_date
FROM xf_post AS post
INNER JOIN xf_thread AS thread ON
(thread.thread_id = post.thread_id)
LEFT JOIN xf_bb_code_parse_cache AS bb_code_parse_cache ON
(bb_code_parse_cache.content_type = 'post' AND bb_code_parse_cache.content_id = post.post_id)
LEFT JOIN xf_user AS user ON
(user.user_id = post.user_id)
LEFT JOIN xf_user_profile AS user_profile ON
(user_profile.user_id = post.user_id)
LEFT JOIN xf_user_privacy AS user_privacy ON
(user_privacy.user_id = post.user_id)
LEFT JOIN xf_bb_code_parse_cache AS signature_parse_cache ON
(signature_parse_cache.content_type = 'signature' AND signature_parse_cache.content_id = post.user_id)
LEFT JOIN xf_session_activity AS session_activity ON
(post.user_id > 0 AND session_activity.user_id = post.user_id AND session_activity.unique_key = CAST(post.user_id AS BINARY))
WHERE (
(post.thread_id = ? AND (post.position >= 0 AND post.position < 10) )
)
AND (post.message_state IN ('visible'))
ORDER BY post.position ASC, post.post_date ASCParams: 313335
Run Time: 0.002143
| Select Type | Table | Type | Possible Keys | Key | Key Len | Ref | Rows | Extra |
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| SIMPLE | thread | const | PRIMARY | PRIMARY | 4 | const | 1 | Using filesort |
| SIMPLE | post | ref | thread_id_post_date,thread_id_position | thread_id_post_date | 4 | const | 1 | Using index condition; Using where |
| SIMPLE | bb_code_parse_cache | eq_ref | content_type_id | content_type_id | 31 | const,xenforo.cc.post.post_id | 1 | Using where |
| SIMPLE | user | eq_ref | PRIMARY | PRIMARY | 4 | xenforo.cc.post.user_id | 1 | |
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| SIMPLE | signature_parse_cache | eq_ref | content_type_id | content_type_id | 31 | const,xenforo.cc.post.user_id | 1 | Using where |
| SIMPLE | session_activity | eq_ref | PRIMARY | PRIMARY | 22 | xenforo.cc.post.user_id,func | 1 | Using where |
INSERT INTO xf_thread_view
(thread_id)
VALUES
(?)
Params: 313335
Run Time: 0.000101
UPDATE `xf_session` SET `expiry_date` = ? WHERE (session_id = 'f066fd33f99de27a718cc6e6321b40e8')
Params: 1716146533
Run Time: 0.000963
INSERT INTO xf_session_activity
(user_id, unique_key, ip, controller_name, controller_action, view_state, params, view_date, robot_key)
VALUES
(?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)
ON DUPLICATE KEY UPDATE
ip = VALUES(ip),
controller_name = VALUES(controller_name),
controller_action = VALUES(controller_action),
view_state = VALUES(view_state),
params = VALUES(params),
view_date = VALUES(view_date),
robot_key = VALUES(robot_key)
Params: 0, 4Ǽ, 4Ǽ, XenForo_ControllerPublic_Thread, Index, valid, thread_id=313335, 1716142933,
Run Time: 0.000144
INSERT INTO xf_bb_code_parse_cache
(content_type, content_id, parse_tree, cache_version, cache_date)
VALUES (?, ?, ?, ?, ?)
ON DUPLICATE KEY UPDATE parse_tree = VALUES(parse_tree),
cache_version = VALUES(cache_version),
cache_date = VALUES(cache_date)
Params: post, 319963, a:13:{i:0;s:1827:"迄今为止，新冠病毒的起源与中间宿主依然成谜，其感染宠物、牲畜的能力也仍未明确。近日，教育部“动物健康与食品安全”国际合作联合实验室等团队发现，已知会感染新冠病毒的物种的ACE2（血管紧张素转化酶2）可以耐受许多氨基酸变化，表明其物种的屏障可能很低，即跨物种传播风险较大。同时，新冠病毒可能未专门适应其任何假定的中间宿主。
团队分析了最新发布的人ACE2与新冠病毒（SARS-CoV-2）的S蛋白受体结合域（RBD）结合的X射线结构，进而预测不同宠物、农场动物、病毒的假定中间宿主等的ACE2与病毒蛋白的结合。
有效结合宿主受体ACE2是新冠病毒感染细胞的首要前提，它决定了病毒宿主的范围。研究人员发现，与人类ACE2相比，蝙蝠、灵猫等的ACE2均发生了大量氨基酸变化，但仍能够与新冠病毒S蛋白结合，其中蝙蝠ACE2蛋白至少包含5个氨基酸变化。
研究指出，宠物（猫）和家养动物有被SARS-CoV-2感染的风险，因为与其他动物相比，它们在ACE2-S蛋白界面处的氨基酸变化较少。
同时，穿山甲的ACE2相对于人类ACE2表现出7个变化，蝙蝠、浣熊和灵猫的ACE2中存在相似数目的取代，这表明SARS-CoV-2可能不特别适应于某一种假定中间宿主的ACE2，即新冠病毒感染动物的机制可能与感染人类的不同。
这些分析为SARS-COV-2入侵受体及其动物来源、自然起源提供了新见解。该研究成果已于近日在线发表在生物医学预印本平台bioRxiv上，题为“Comparison of SARS-CoV-2 spike protein binding to human, pet, farm animals, and putative intermediate hosts ACE2 and ACE2 receptors”。
研究团队包括南京农业大学";i:1;a:4:{s:3:"tag";s:3:"url";s:6:"option";s:145:"https://c.duomai.com/track.php?k=yUSQzUycwRHdo1Ddm0DZpVXZmkDN2ITPklWYmYDO5IDNy0DZp9VZ0l2cmYiJ05WZkVHdzZkMl42Yu02bj5SZy9GdzRnZvN3byNWat5yd3dnRyUiR";s:8:"original";a:2:{i:0;s:153:"[URL='https://c.duomai.com/track.php?k=yUSQzUycwRHdo1Ddm0DZpVXZmkDN2ITPklWYmYDO5IDNy0DZp9VZ0l2cmYiJ05WZkVHdzZkMl42Yu02bj5SZy9GdzRnZvN3byNWat5yd3dnRyUiR']";i:1;s:6:"[/URL]";}s:8:"children";a:1:{i:0;s:6:"教育";}}i:2;s:299:"部“动物健康与食品安全”国际合作联合实验室、德国柏林自由大学兽医学院病毒学研究所、中国农业科学院长春兽医研究所等，研究通讯作者为南京农业大学动物医学院教授、博士生导师粟硕以及柏林自由大学的Michael Veit。
";i:3;a:4:{s:3:"tag";s:1:"b";s:6:"option";N;s:8:"original";a:2:{i:0;s:3:"[B]";i:1;s:4:"[/B]";}s:8:"children";a:1:{i:0;s:80:"蝙蝠、灵猫等ACE2可耐受大量氨基酸变化，仍与新冠S蛋白结合";}}i:4;s:1781:"
研究表明，SARS-CoV-2可能起源于蝙蝠，穿山甲可能是潜在的中间宿主。具体而言，SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒RaTG13具有高度核苷酸序列同一性，只是其基因组的中间部分、编码病毒S蛋白的基因可能是通过与穿山甲样冠状病毒重组而来。
新冠病毒的S蛋白负责与受体结合入侵宿主，在感染过程中，S蛋白被宿主蛋白酶裂解为S1亚基和S2亚基，分别介导受体结合和膜融合。其中，S1包含受体结合结构域（RBD），在确定组织向性和宿主范围方面至关重要。
在病毒入侵人体时，RBD会与人类受体ACE2（血管紧张素转化酶2）结合。ACE2是新冠病毒和SARS-CoV（严重急性呼吸系统综合征冠状病毒）共同的人类受体膜蛋白，与人血管紧张素转化酶1具有同源性，在人类心血管系统和许多其他器官中显示出保护作用。
先前的研究表明，SARS-CoV-2在狗、猪体内的复制能力很差，但猫却可能被感染。研究人员利用比较生物信息学和结构方法，分析了与SARS-CoV-2的S蛋白受体结合域结合的人ACE2的X射线结构以及病毒S蛋白结构。
由于含有编码ACE2受体的海拉（Hela）细胞系发生了不同的转染，人、猪、灵猫和蝙蝠的ACE2都对SARS-CoV-2易感，但小鼠的ACE2则不敏感。
为了评估ACE2中哪些相互作用的氨基酸对于其与病毒S蛋白的结合必不可少，研究人员将人类的ACE2序列与其他物种的ACE2序列进行了比较，进而确定了对病毒与ACE2结合起关键作用的氨基酸位点。
研究表明，新冠病毒入侵时，其S蛋白中的17个残基与ACE2中的20个氨基酸接触，其中8个氨基酸与S蛋白中的13个残基形成氢键。
";i:5;a:4:{s:3:"tag";s:3:"img";s:6:"option";N;s:8:"original";a:2:{i:0;s:5:"[IMG]";i:1;s:6:"[/IMG]";}s:8:"children";a:1:{i:0;s:91:"https://rdimg.com/proxy/https://static.cnbetacdn.com/article/2020/0512/4158e0e4df34fd9.jpeg";}}i:6;s:441:"
SARS-CoV-2的S蛋白（绿色）和人ACE2（蓝色）的相互作用表面
根据先前的研究，SARS-CoV-2的S蛋白与其受体的亲和力比SARS-CoV的S蛋白结合亲和力更高。SARS-CoV-2中的氨基酸比与ACE2相互作用时会形成更多的氢键。
研究人员发现，相比于人类ACE2，猪的ACE2在与SARS-CoV-2的S蛋白相互作用的表面上有5个氨基酸取代，其中3个位于结合位点的外围。
";i:7;a:4:{s:3:"tag";s:3:"img";s:6:"option";N;s:8:"original";a:2:{i:0;s:5:"[IMG]";i:1;s:6:"[/IMG]";}s:8:"children";a:1:{i:0;s:91:"https://rdimg.com/proxy/https://static.cnbetacdn.com/article/2020/0512/b2a23587b3a7f5a.jpeg";}}i:8;s:1709:"
与人类ACE2相比，猪的ACE2在与SARS-CoV-2的S蛋白相互作用的表面上存在的氨基酸取代，5个取代位置红色标出
研究人员从数据库中提取了3组中华菊头蝠ACE2基因氨基酸序列，它们分别来自广西、湖北和云南。令人惊讶的是，尽管它们的整体氨基酸同一性很高（99％），但在与病毒S蛋白接触的N末端氨基酸中显示出较大的差异。
研究人员发现，蝙蝠ACE2蛋白相较于人ACE2至少包含5个氨基酸变化，其中3个在所有蝙蝠ACE2序列中均被取代，并具有与猪ACE2中相同的残基，但被其他氨基酸取代。团队认为，蝙蝠作为被普遍认为的新冠病毒天然宿主，不同地区中华菊头蝠之间ACE2基因表现出如此多的变化令人惊讶，需要进一步研究。但是，一个比较容易推测出的原因是，蝙蝠和新冠病毒之间的局部共同进化会驱动这些氨基酸变化。
接下来，研究人员分析了灵猫体内的ACE2，其已被证明可以作为SARS-CoV-2的受体。 灵猫的ACE2相对于人ACE2共有7个氨基酸变化，其中3个与猪的ACE2中的取代相同。
与猪、蝙蝠、灵猫相比，不支持SARS-CoV-2细胞感染的小鼠ACE2在与SARS-CoV-2的S蛋白相互作用的表面上有8个氨基酸取代。
总之，部分动物ACE2与与人类ACE2相比，和新冠病毒S蛋白相互作用表面中大量的氨基酸变化都不影响其结合，其中猪ACE2中有5个氨基酸取代，而灵猫ACE2中则有7个氨基酸变化。
即使蝙蝠ACE2在多次氨基酸取代过程中获得了新的重要的N-糖基化位点，也不能阻止SARS-CoV-2将蝙蝠ACE2用作转染细胞中的受体。
";i:9;a:4:{s:3:"tag";s:1:"b";s:6:"option";N;s:8:"original";a:2:{i:0;s:3:"[B]";i:1;s:4:"[/B]";}s:8:"children";a:1:{i:0;s:75:"新冠能否跨越物种障碍？跨物种传播风险大，需持续监测";}}i:10;s:616:"
此前4 月 3 日，华中农业大学金梅林教授、中科院武汉病毒所石正丽教授团队等合作在 bioRxiv上发布研究论文称，102只猫的血清ELISA检测显示，来自15只猫（14.7％）的血清对新冠病毒的受体结合域（RBD）呈阳性。但迄今为止，没有证据表明猫会传染人。
在本研究中，科研人员也探讨了新冠病毒S蛋白在与受体ACE2的结合时在宠物中物种障碍（跨物种传播）的情况。与人类相比，狗的ACE2与病毒S蛋白接触的氨基酸中包含5个氨基酸变化，其中3个在猪的ACE2中也被取代。
";i:11;a:4:{s:3:"tag";s:3:"img";s:6:"option";N;s:8:"original";a:2:{i:0;s:5:"[IMG]";i:1;s:6:"[/IMG]";}s:8:"children";a:1:{i:0;s:91:"https://rdimg.com/proxy/https://static.cnbetacdn.com/article/2020/0512/21fa957442d7853.jpeg";}}i:12;s:2908:"
狗的ACE2与病毒S蛋白接触时的氨基酸变化
与人类相比，猫的ACE2仅有4个氨基酸变化，它们也存在于狗的ACE2中。研究人员此前分析了来自猪、狗和猫的ACE2与病毒S蛋白结合的能力，结果表明，SARS-CoV-2在狗中的复制能力较弱，但在猫中却能够有效复制，并通过飞沫传播给别的猫。
此前有报道称，纽约市布朗克斯动物园的老虎和狮子被感染了SARS-CoV-2。因此研究人员分析了它们的ACE2基因。在猫和老虎的ACE2中，研究人员检测到1个氨基酸差异，但它们与病毒S蛋白接触的残基相同，这解释了为什么老虎也易受SARS-CoV-2感染。
与猫ACE2相比，狮子的ACE2存在另一个较保守的变化，并且与狗ACE2一样，它的一个N-糖基化位点丢失。
研究人员接下来分析了动物模型显示传播新冠风险较高的几种动物。最近的研究表明，雪貂对SARS-CoV-2感染敏感度较高，尽管效率较低，但可以通过飞沫传播病毒。研究结果表明，雪貂ACE2表现出与狗ACE2完全相同的5个氨基酸变化。
此外，叙利亚仓鼠（Syrian hamster）的ACE2蛋白与人类ACE2相比，仅包含两个氨基酸取代；作为较高新冠病毒易感性的动物模型，也作为部分家庭的宠物，豚鼠的ACE2有7个氨基酸取代。
在农场动物中，鸡的ACE2蛋白含有10个氨基酸变化，并且在标号为90的位置丢失了1个N-糖基化位点。鸭子的ACE2也有10个氨基酸取代，研究认为，鸡鸭缺乏对实验性SARS-CoV-2的敏感性似乎是由于
病毒不能结合禽类ACE2受体。牛和羊的ACE2与人类相比，只有两个氨基酸变化，而且保留了在人ACE2的90位置的N-糖基化位点。因此，这两种物种的ACE2蛋白都可能起到SARS-CoV-2受体的作用，并且很有可能是易感性较高的动物模型，研究人员指出，需要加强监控以显示它们是否对SARS-CoV-2易感。
总体而言，几乎所有已知易受SARS-CoV-2感染的哺乳动物物种（猫和雪貂）在其ACE2蛋白的许多氨基酸中都有突变。这表明这些物种、特别是其中与人类密切接触的物种，有感染病毒的危险，SARS-CoV-2可能会在其中一种动物中建立起额外的病毒库。
研究人员还发现，猪不会被新冠病毒感染、而狗不会被有效感染，这两种动物ACE2的结合位点与人类相比仅有少量变化，但它们呼吸道中的ACE2水平相对较低。
这也表明，病毒的S蛋白与ACE2受体的结合只是病毒入侵的第一步，而且同一物种不同组织中ACE2的水平也可能在病毒传播中起重要作用，例如，ACE2在某些宠物和牲畜的上呼吸道中的表达较低。因此，研究团队认为新冠病毒动物感染的风险需要持续监测，以探索动物的感染源和潜在的跨物种传播风险。";}, 1621686945, 1716142933
Run Time: 0.001184